MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 6568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009051	GAG	2	6	1196317	1196322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_009051	TTG	2	6	1196725	1196730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_009051	CCTT	2	8	1197499	1197506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_009051	GGC	2	6	1197528	1197533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_009051	AGGA	2	8	1197546	1197553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_009051	GTAT	3	12	1197574	1197585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_009051	GAG	2	6	1197602	1197607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_009051	CGG	2	6	1197623	1197628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_009051	CGG	2	6	1198190	1198195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_009051	GAA	2	6	1198203	1198208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_009051	GAG	2	6	1198212	1198217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_009051	CGG	2	6	1198252	1198257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_009051	ATG	2	6	1198258	1198263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_009051	GAG	3	9	1198284	1198292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_009051	GAA	2	6	1198296	1198301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_009051	GAA	2	6	1198320	1198325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_009051	CGG	2	6	1198328	1198333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_009051	TCG	2	6	1198396	1198401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_009051	T	7	7	1198453	1198459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_009051	T	6	6	1198507	1198512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_009051	GGA	2	6	1198519	1198524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_009051	GA	3	6	1198527	1198532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_009051	TCA	2	6	1198546	1198551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_009051	G	6	6	1198640	1198645	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_009051	C	6	6	1198651	1198656	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3026	NC_009051	CCT	2	6	1198760	1198765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_009051	TG	3	6	1198828	1198833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_009051	GT	3	6	1198842	1198847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_009051	CAT	2	6	1199455	1199460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_009051	GAT	2	6	1199473	1199478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_009051	A	7	7	1199542	1199548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_009051	AC	3	6	1200018	1200023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_009051	GCAG	2	8	1200048	1200055	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_009051	AAAC	2	8	1200062	1200069	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_009051	ATA	2	6	1200213	1200218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_009051	AT	4	8	1200234	1200241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_009051	GCG	2	6	1200319	1200324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_009051	GGGA	2	8	1200343	1200350	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_009051	CGG	2	6	1200374	1200379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_009051	GCCG	2	8	1200390	1200397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_009051	GCA	2	6	1200508	1200513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_009051	CAC	2	6	1200607	1200612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_009051	CT	3	6	1200633	1200638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_009051	TGC	2	6	1200713	1200718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_009051	CTC	2	6	1200722	1200727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_009051	GGACAT	2	12	1200797	1200808	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3047	NC_009051	GGC	2	6	1200822	1200827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_009051	GCG	2	6	1200848	1200853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_009051	GTC	2	6	1200856	1200861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_009051	TGC	2	6	1200880	1200885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_009051	GAT	2	6	1201040	1201045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_009051	ATC	2	6	1202294	1202299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_009051	GAT	2	6	1202307	1202312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_009051	TCC	2	6	1202351	1202356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_009051	AGCC	2	8	1202407	1202414	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_009051	GTG	2	6	1202478	1202483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_009051	GTG	2	6	1202487	1202492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_009051	CGGCA	2	10	1202534	1202543	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3059	NC_009051	GA	3	6	1202548	1202553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_009051	TCC	2	6	1202579	1202584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_009051	CAC	2	6	1202591	1202596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_009051	ATCG	2	8	1202835	1202842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_009051	GGA	2	6	1202888	1202893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_009051	ACCG	2	8	1203467	1203474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_009051	A	6	6	1203495	1203500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_009051	CGG	2	6	1203529	1203534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_009051	GAA	2	6	1203542	1203547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_009051	AGT	2	6	1204735	1204740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_009051	ATT	2	6	1204792	1204797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_009051	TCCG	2	8	1204846	1204853	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_009051	ATA	2	6	1204889	1204894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_009051	A	6	6	1204917	1204922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_009051	CATC	2	8	1205725	1205732	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3074	NC_009051	CGGT	2	8	1207239	1207246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_009051	T	7	7	1207323	1207329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_009051	AGA	2	6	1207375	1207380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_009051	CGC	2	6	1208039	1208044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_009051	CTC	2	6	1208047	1208052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3079	NC_009051	C	7	7	1208093	1208099	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3080	NC_009051	CT	3	6	1209351	1209356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_009051	ATA	2	6	1209441	1209446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_009051	AGT	2	6	1210052	1210057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_009051	A	6	6	1210100	1210105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_009051	CCT	2	6	1210110	1210115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_009051	GTC	2	6	1216780	1216785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_009051	TAG	2	6	1217964	1217969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_009051	AAG	2	6	1217988	1217993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_009051	GAA	2	6	1218081	1218086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_009051	TCG	2	6	1218156	1218161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_009051	TTC	2	6	1218162	1218167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_009051	GA	3	6	1218226	1218231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_009051	GCA	2	6	1218248	1218253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_009051	TC	3	6	1218511	1218516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_009051	TTC	2	6	1218586	1218591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_009051	GTT	2	6	1218602	1218607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_009051	CTT	2	6	1218639	1218644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_009051	GCG	2	6	1219128	1219133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_009051	CT	3	6	1219145	1219150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_009051	CCG	2	6	1219158	1219163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_009051	TC	3	6	1219955	1219960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_009051	ATC	2	6	1219964	1219969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_009051	AAT	2	6	1219992	1219997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_009051	G	6	6	1220018	1220023	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_009051	GA	5	10	1220034	1220043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_009051	GGC	2	6	1220127	1220132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_009051	GAA	2	6	1220170	1220175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_009051	TCG	2	6	1220187	1220192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_009051	CGG	2	6	1220228	1220233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_009051	TCAA	2	8	1220236	1220243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_009051	CTG	2	6	1220284	1220289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_009051	CGG	2	6	1220755	1220760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_009051	CCT	2	6	1220802	1220807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_009051	CCT	2	6	1220842	1220847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_009051	TACG	2	8	1225095	1225102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3115	NC_009051	CCGG	2	8	1225139	1225146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_009051	ACGG	2	8	1225184	1225191	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_009051	ACGCG	2	10	1229406	1229415	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3118	NC_009051	GCC	2	6	1229785	1229790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_009051	GCA	2	6	1229811	1229816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_009051	CAA	2	6	1229837	1229842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_009051	CTT	2	6	1229845	1229850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_009051	GAA	2	6	1229858	1229863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_009051	CGG	2	6	1229866	1229871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_009051	A	6	6	1229985	1229990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_009051	GC	3	6	1230618	1230623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_009051	TTG	2	6	1232394	1232399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_009051	CGG	2	6	1232444	1232449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_009051	CG	3	6	1232465	1232470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_009051	T	6	6	1232558	1232563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_009051	TGA	3	9	1232658	1232666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_009051	CAG	2	6	1232681	1232686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_009051	TTTC	2	8	1232707	1232714	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3133	NC_009051	TCT	2	6	1232715	1232720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_009051	CTC	2	6	1232784	1232789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3154	NC_009051	TCC	2	6	1234615	1234620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3242	NC_009051	CTTA	2	8	1261564	1261571	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3243	NC_009051	T	6	6	1261811	1261816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3250	NC_009051	GAA	2	6	1263530	1263535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_009051	A	10	10	1263570	1263579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_009051	TGA	2	6	1265781	1265786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_009051	GTC	2	6	1265792	1265797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3254	NC_009051	CTC	2	6	1265858	1265863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3255	NC_009051	CCGG	2	8	1265887	1265894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3256	NC_009051	T	7	7	1266491	1266497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_009051	GCA	2	6	1266508	1266513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_009051	CA	3	6	1266581	1266586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3259	NC_009051	GCCCCC	2	12	1266671	1266682	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
3260	NC_009051	CGGGG	2	10	1266683	1266692	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3261	NC_009051	GAG	2	6	1266738	1266743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3263	NC_009051	GACG	2	8	1266765	1266772	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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